Diseño y validación de QTL relacionados con peso de mil granos en trigo harinero de primavera
Objetivos
Diseñar ensayos SNP KASP asociados con peso de mil granos a partir de resultados de genotipificación por secuenciación.
Verificar el SNP KASP por su funcionalidad técnica y asociación con el rasgo.
Validar la introgresión del QTL mediante selección asistida por marcadores moleculares, al menos 1 QTL en 2-3 líneas de trigo elites de diferentes orígenes.
Expectativas de trabajo
Disponibilidad para trabajar en el laboratorio y en el invernadero.
Aprendizaje y aplicación de herramientas bioinformáticas.
Aprendizaje y aplicación de herramientas para análisis de datos, y estadística básica para genética.
Habilidades requeridas
Grado de licenciatura
Conocimientos básicos de genética.
Conocimientos básicos en fitomejoramiento.
inglés básico
Actividades
Utilizar software de diseño de cebadores y los enfoques BLASTn para desarrollar ensayos SNP KASP que ayuden a seleccionar los haplotipos con mayor efecto en peso de mil granos.
Probar los ensayos SNP KASP en el germoplasma de trigo original y otros germoplasmas relevantes de CIMMYT para comprobar su funcionalidad técnica.
Utilizar los datos del ensayo SNP KASP y mapearlos nuevamente en las poblaciones originales para verificar su asociación con el peso de mil granos.
Seleccionar 2-3 líneas de trigo élite relevantes para CIMMYT (con peso de mil granos: alto, intermedio y bajo) continuar en el invernadero con la introgresión del QTL a las líneas seleccionadas.
Generar BC3F4 líneas isogénicas y medir el peso de mil granos para validar el QTL.